Situasi dan kondisi Setu Citayam pada masa ini berbeda dengan masa doeloe. Di masa lampau, setu ini dipenuhi oleh berbagai tanaman air seperti ganggang dan bunga teratai. Dalam rangka untuk memperbanyak kolam penampungan air di hulu Kota Jakarta, salah satunya adalah memfungsikan Setu Citayam. Kemudian setu dibersihkan, diperdalam dan dibendung yang diharapkan akan menjadi tempat resapan air. Pada tahun 2008 Mahasiswa Pecinta Alam Atmajaya pernah bekerja sama dengan Bank Mandiri untuk menanam 500 pohon jati di kawasan setu. Pohon-pohon ini diharapkan bisa memperindah kawasan setu. Keutamaan setu ini adalah karena memiliki ekosistem yang ideal (pada masa dulu) untuk riset dan tentu saja pada masa ini penting untuk dijadikan reservoir atau tempat penampungan air. Selain itu, Setu Citayam ini juga sesungguhnya adalah asli hulu dari Kali Krukut yang mengalir ke tengah Kota Jakarta. Sebagai sumber air Kali Krukut, maka pintu air Setu Citayam dibuka di musim kemarau dan ditutup di musim hujan. Setu Citayam dengan sendirinya berfungsi sebagai pengatur debit air Kali Krukut.

Daya pasok air Setu Citayam ke hilir Sungai Krukut dikaitkan dengan keberadaan sungai Kali Baru. Sungai Kali Baru ini dipecah di Citayam (selatan pasar yang sekarang/batas Kota Depok dan Kabupaten Bogor) ke timur mengaliri Ratu Jaya, Depok dan Pondok Cina, ke barat mengaliri Cipayung, Sawangan dan Limo. Posisi Setu Citayam ini berada diantara dua pecahan Kali Baru ini. Dengan demikian, Kali Baru ini juga mensuplai air ke dalam Setu Citayam yang pada gilirannya juga akan mengalir melalui Kali Krukut. Kali Baru sendiri adalah kali yang sumber airnya disodet dari Sungai Cisadane di Empang/Pancasan Kota Bogor pada era Belanda melalui Cimanggu, Cilebut, Bojong Gede hingga ke Citayam.

Setu ini sudah dimanfaatkan sebagai area perikanan dan wisata air. Pada sisi setu sebelah selatan (dekat Stasion Citayam) dimanfaatkan masyarakat untuk perikanan dalam bentuk karamba. Sedangkan untuk wisata air dikelola oleh sebuah kelompok kerja (Pokja) masyarakat yang dibentuk sebagai pelaksana teknis pengelolan setu yang menjadi bagian dari program pemberdayaan masyarakat Pemerintah Kota Depok. Program wisata air ini meliputi pengadaan perahu-perahu kecil dan kendaraan air serta pembuatan dermaganya